Kľúčový rozdiel: Katolícka biblia obsahuje pôvodné štyridsať šesť kníh Starého zákona (ktorý obsahuje sedem kníh Apokryfy) a dvadsaťsedem kníh Nového zákona. Protestantská biblia obsahuje iba tridsať deväť kníh Starého zákona a dvadsaťsedem kníh Nového zákona.
Hlavným rozdielom medzi katolíckymi a protestantskými cirkvami je ich presvedčenie o Bibliách. Katolíci považujú Biblicku za rovnocennú autoritu s Cirkvou a tradíciou, zatiaľ čo protestanti považujú Bibli za najvyššiu autoritu pre vieru a prax.
Treba poznamenať, že Biblia nie je len jedna kniha; je to zbierka kníh od spisov po historické udalosti. Je to knižnica príbehov o živote Ježiša, jeho apoštoloch a ich životoch po tom, ako Ježiš zomrel na kríži. Koncom 4. storočia sa tieto rôzne zväzky a príbehy dostali do jedného zväzku, ktorý je v podstate moderná biblia, ako ju poznáme. Moderná Biblia sa skladá z dvoch častí: Starého zákona a Nového zákona.
Katolícka aj protestantská bibli zahŕňajú nový zákon v rovnakom formáte. Rozdiel vzniká v Starom zákone. Starý zákon, ktorý je súčasťou protestantskej biblie, podstúpil kánonizáciu doktrín alebo kníh. Kánonizácia je proces výberu, ktoré knihy by mali zostať a stať sa súčasťou Biblie a ktoré by mali byť vylúčené. Protestantská biblia obsahuje iba tie knihy, ktoré boli považované za Božie slová. Knihy a príbehy, ktoré boli považované za písané "človekom", boli vylúčené. Tento proces kánonizácie trval mnoho storočí.
Starý zákon v pôvodnej Biblie bol založený na gréckom preklade Židovského písma, nazývaného Septuagint. Okolo roku 100 nl židovskí rabíni revidovali svoje Písmo a ustanovili oficiálny kánon judaizmu, ktorý vylučoval niektoré časti gréckeho Septuaginta.
Knihy boli odstránené: Tobit, Judith, 1 Macabees, 2 Macabees, Múdrosť (Šalamún), Sirach a Baruch. Boli tiež odstránené časti existujúcich kníh, vrátane žalmu 151 (z žalmov), častí Esterovej knihy, Susanna (z Daniela ako kapitola 13) a Bel a drak (z Danielu ako kapitola 14).
Rímskokatolícka cirkev však nesledovala kroky evanjelikov a pokračovala v zakladaní svojho Starého zákona na Septuagintu. Takže v podstate katolícka biblia stále obsahuje pôvodné štyridsať šesť kníh Starého zákona (ktorý obsahuje sedem kníh Apokryfy) a dvadsaťsedem kníh Nového zákona. Protestantská bibli na druhej strane teraz obsahuje tridsať deväť kníh Starého zákona a dvadsaťsedem kníh Nového zákona.